医療情報学II 文献検索 (PubMed編)
Last Update: 2019.05.18
PubMedサイト https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/ にアクセスします。
検索語句の欄に検索語を入力します。
途中まで入力すると、下に候補で出てきます。
検索語を " " で囲むと、その語に厳密にマッチするものが釣れます。
裸だと、システムが語の「ゆらぎ」や類語を考慮して選択した結果が表示されます。
検索語は "isolated systolic hypertension" （別の疾患に随伴したものでない（本態性の）収縮期高血圧）で良いと思います。
入力したら、右側のSearch ボタンを押します。検索候補を選択して自動入力すると、Searchボタンを押さなくても検索がはじまります。
3,000個弱くらい、釣れると思います。中央には書肆情報が出てきます
次に、左側に出ているフィルタを使って、絞り込みます。
まず、一番下のshow additional filtersを押し、Journal categories と Ageの項目にチェックを入れて、Show ボタンで左カラムに追加表示させてください。
左カラムの項目を押すとチェックマークが付いて、その項目のフィルタが働いて絞り込みます。
欲しい項目がカラムに出ていない時はCustomize...をクリックし、出てきた小ウインドゥから項目を選んでチェックマークを入れて「show」ボタンを押すと、選んだ項目が左カラムに表示されますので、表示されたら選択して絞り込んでいって下さい。
Article types は、最後に絞り込むことにします：
Meta-Analysis：
Randomized Controlled Trial：
（場合によってはSystematic Reviewsも）
などを選択すると良いでしょう。
Text availabilityでは：
今回は、後で魔法をかけますので何もつけなくても良いです
（通常は「抄録だけ」、「無料で読める文献の全文」、「有料、無料を問わず読める文献の全文」のいずれかを選択します）。
Publication datesでは：
今回は、何もつけなくても良いです
（新しい文献のみを読みたい時は、５年間、または10年間を選択します）。
Speciesでは：
臨床研究の論文を読みたいのでHumans を選択します。数が2,000個くらいになります。
Languagesでは：
通常、English を選択します
（今回は、何もつけなくても良いです）。
Journal categoriesでは：
Core clinical journals を選択します
（これが「魔法」のひとつです）。レベルの高い雑誌だけを選択することで、「あやしい」論文や対象が著しく限局されている論文を除外します。300個くらいに絞り込まれると思います。
Agesでは：
Aged: 65+ years を選択します
（別法として、検索語に elderly または aged を加えても、同様の結果が得られます ）。ここまでで、200個くらいに絞れます。
Article types で絞り込むこんでみます
Meta-Analysis：Randomized Controlled Trial (RCT)：Reviews
の３つを選択すると、70個弱になります。
Meta-Analysis と Randomized Controlled Trial (RCT) を選択すると、40個強、絞り揉まれます。
実際には：
"isolated systolic hypertension"[All Fields] AND ((Randomized Controlled Trial[ptyp] OR Meta-Analysis[ptyp]) AND hasabstract[text] AND jsubsetaim[text] AND "aged"[MeSH Terms])
という検索語で絞り込んでいるのと同じになります。
このように、絞り込みが進んで行くにしたがって、中央カラム左上の「Results: 1 to 20 of XXX」のXXXが減ってゆくのがわかると思います。こうして、40~70個程度の文献まで絞れます。
通常は、このくらいまで絞ったうえで、タイトルを見て（場合によってはAbstractも読んで）、おじさんのアウトカムに合致した文献を選びます(（チェックを付ける）。たとえば、アウトカム (Outcome) に応じて、対象が糖尿病患者さんだったりするような「おじさん」とは違う条件の論文や、特定のお薬について薬効を検討している論文などを捨てます（チェックを付けない）。
今日は、これらの中から、先日、抄録 (Abstract)を読んだ SHEP研究の患者さんを長期間フォローして、実際に寿命がどうなったのか？延命効果があったのならその程度はどのくらいか？を報告した論文を探したいと思います。
では、上部の検索窓（すでに isolted systolic hypertension が入っています）の右横に、半角空けて SHEP と入力し、検索ボタンを押してください。
SHEP研究に関する文献（論文）が（おそらく14報）釣れてくると思います。これらの中から、寿命がどうなったのか？延命効果があったのならその程度はどのくらいか？を報告した論文を探してください。
チェックを付けた文献をリスト表示させ、最後に、抄録をさっと眺めて（タイトルをクリックすると、抄録が出てきます）、自分の探している文献を選び出します。